Arlequin app下载,能够分析编码为SNP的DNA序列数据(即0,1,2,3而不是C,A,T,G)。Arlequin最新版 可以使用64位版本的arlecore进行计算(更快,可能更大的数据集),更有效更快地读取长DNA序列,Arlequin现在可以读取多达100万个字符的行,删除了xml文件中的非法字符。如果你需要使用这款软件就下载rlequin吧!
Arlequin允许您指定应构建的项目大纲的类型。 使用“浏览”按钮为项目选择名称和硬盘位置。
等位基因频率数据
原始数据仅由等位基因频率组成(仅限单基因座处理),因此这些数据不需要单元型信息。 然后仅比较群体样本的等位基因频率。
多态性的分子基础没有特别限定,或者当不同的等位基因被认为是彼此突变等距时。 因此比较标准数据单倍型在每个基因座处的含量,而不特别关注等位基因的性质,其可以是相似的或不同的。 例如,HLA数据(人类MHC)进入标准数据类别
RFLP数据
Arlequin可以处理任意长度的RFLP单倍型。每个限制性位点被认为是不同的基因座。限制性位点的存在应编码为“1”,其缺失为“0”。 “ - ”字符应该用于表示网站的删除,而不是由于点突变而导致的缺失。
微卫星数据
原始数据在此包括一个或任意数量的微卫星基因座的等位基因状态
标准指数
一些多样性测量,如多态性位点的数量,基因多样性。
分子多样性
计算几个多样性指数,如核苷酸多样性,群体参数θ的不同估计量。
不匹配分布
单倍型之间成对差异数量的分布,可以估计人口统计学(新)或空间人口扩张的参数
单倍型频率估计
通过最大似然法估计群体中存在的单倍型的频率。
配子相位估计(新)
估计最喜欢的游戏阶段
使用伪贝叶斯方法(ELB算法)的多基因座基因型。