在1988年PC-E光碟机出现的几个月之前，世嘉便在市场推出了一款真正的16位主机。Mega Drive售价为21000曰元，采用主频为9M的68000型RISC处理器，内存包括72K RAM和64K VRAM，同屏发色数达64色，在整体性能上比起当时的FC和PC-E高出不少。世嘉也自豪的宣称，这款主机是“下个时代的游戏主机”。MD的手柄设计尤其值得称道，在当时FC等主机手柄几乎没有经过专业设计，而MD手柄则是第一款根据人体工学设计的手柄，把持感相当舒适。MD手柄开创性的使用独特设计为这款主机赢得了不少的好评，在其后索尼等公司也不断仿效世嘉的做法在手柄上大作手脚。
MD可以说是在FC和SFC夹缝中生存的一款主机，世嘉抓住任天堂新旧主机交换的历史时期，率先推出16位主机，抢占了不少看中主机性能的较高年龄层市场。在家用机市场上不断失利的世嘉也认识到了RPG这种游戏类型在曰本市场的重要性，于是接连制作了不少至今仍脍炙人口的作品。可惜的是缺乏第三方支持的世嘉并没有多少RPG制作经验，MD上的一些知名RPG系列也从未达到过FF和DQ的高度。在SFC发售之后，伴随着一个个2D时代究级RPG的推出，MD逐渐被人们所遗忘。世嘉虽然不断推出类似MEGA CD、SUPER 32X等强化周边，不过缺乏软件支持的这款主机最终还是回天乏术
第一款《梦幻之星》由于出色的画面、3D的迷宫、壮阔的世界观获得了不少玩家的喜爱，因此当MD发售之后，人们就强烈希望在这一新时代主机上看到一款更加华丽的RPG。89年3月《梦幻之星2》的诞生让人们见识了16位主机上RPG的魅力。
《梦幻之星2》再度扩大了前作的舞台。游戏故事发生在前作500年之后。地球人的恒星间机动要塞诺亚经过长期的宇宙探索，终于侵入了阿尔戈尔太阳系。他们试图重建帕尔玛文明，并逐步掌握了当地的社会管理系统。同时原帕尔玛人开始全面反抗，他们暗中成立了反抗组织。不久后深远之暗的复活计划正式开始。莫塔比亚的BIOSYSTEM发生异常。主人公尤西斯授命调查那些BIO怪物们的真相。这中间暗黑佛在帕尔玛复活，尤西斯被囚禁在监狱卫星盖拉，脱出之际，卫星盖拉和帕尔玛主星发生碰撞，帕尔玛崩坏。之后，尤西斯和他的伙伴们终于打倒了暗黑佛和邪恶的地球人。
由于是在新一代主机上推出的游戏，《梦幻之星2》在画面以及音乐上远远超出了之前的8位机游戏。色彩艳丽的角色画像、电脑空间的战斗背景，以及实际游戏中轮廓鲜明的人物形象都让人印象深刻。游戏中个性鲜明的人物也让人久久不能忘怀，迟钝的罗尔夫、脆弱的妮、神秘的安娜、乐天派的盗贼西罗等都刻画得十分成功。游戏在情节方面也朝着更加成人化方向发展，故事极具深度。主角们的冒险之路充满荆棘坎坷，游戏时刻带给玩家“人生无常”的思想，最后妮的死更是充满了煽情元素。游戏在系统上最大的创新是玩家可以从7个角色中选择自己最喜欢的4个组成冒险队伍。游戏中还加入了可以自动修复记录中BUG的功能，以及自动战斗系统，让讨厌RPG战斗的玩家们省了不少事。
《梦幻之星3》
数“梦幻之星”FANS对《梦幻之星2》推崇备至，却对第三作十分失望。原因或许是因为故事没有前作那么恢宏壮阔，进化程度也不够明显。事实上这款游戏确实具有极高的创新程度，其中最为明显的当数游戏中分章节的故事发展方式。与DQ4不同的是，《梦幻之星3》是以时间顺序分为三个时代的故事。游戏故事一开始就是结婚事件的选择，关系到主人公习得魔法技术等等一系列后续分支，甚至包括所生子女也就是新的主人公的发展方向。这样一种系统理论上可以产生丰富的分支情节。可惜的是，出于游戏规模的考虑，游戏的分支结局仅有四个。并且在结局之前的主题部分，包括迷宫、情节发展、特殊事件等也基本一致。不过该作首创的“世代传承”的情节发展方式意义可谓相当深远。《梦幻之星3》中也终于出现了自己的吉祥物，就是那只胖乎乎的小黄鸟“拉芘鸟”。
《梦幻之星4 千年的终结》
梦幻之星3》被认为是一个不进反退的作品，而《梦幻之星4 千年的终结》则是回归原点的终结之作。1993年12月发售的这款游戏与前作相隔了3年，因此游戏中经典设定的回归让人感动。游戏故事发生在《梦幻之星2》的1000年之后。主角路迪等人终于洞悉了阿尔戈尔太阳系的秘密，用集合了历代牺牲的勇者的灵魂之剑，将深远之暗打倒，阿尔戈尔太阳系终于恢复了和平。作为对系列历史的一次回顾，这款游戏制作得相当用心。冒险过程中时刻给人以亲切得熟悉感觉，协力攻击等全新元素的加入让游戏更加精彩。甚至最终BOSS、以往作品中出现的深远之暗也让人倍感亲切
首个打入国际市场的S·RPG——《光明力量》
曾经制作两款《勇者斗恶龙》的高桥兄弟在成立CLIMAX之后就成了独立游戏制作公司。不久后这对乐于迎接挑战的兄弟决定在当时机能最强的MD上制作一款RPG。正苦于没有RPG支持的世嘉自然对此大为欢迎，不仅提供资金和技术援助还成立了专门小组协助开发。于是在1991年，一款采用3D视点迷宫名叫《光明与黑暗》的RPG诞生了。不过这款游戏在当时并没有引起多大反响。真正让“光明”系列大放光芒的是一年之后的续作。
90年以及92的两款《火焰纹章》让人们见识了S·RPG的独特魅力，然而这种曰系战略RPG的在当时的影响力并不是很高，并且尚未有哪一款曰系S·RPG打入国际市场。在美国，诸如《魔法门》等衍生自AD&D的RPG经过多年发展逐渐失去了其RPG本质，成为纯粹的战略或者动作游戏。在电子游戏市场，一些来自曰本的RPG赢得了一部分市场份额，形成了以A·RPG为主的玩家群。不过正统RPG市场影响力依然很小，至于S·RPG则是美国玩家从未耳闻的游戏类型。
1992年3月，采用S·RPG类型的《光明力量 众神的遗产》在曰本上市。游戏以其出色品质一扫前作萎靡之势，取得了一定的反响。不过该作更大的成功则是来自海外。1993年，世嘉将《光明力量》带到了美国。由于MD在美国的普及率远高于曰本本土，SFC在美国市场上也从未有同类游戏推出。《光明力量》成为第一款打入国际市场的S·RPG。《光明力量》在情节上并无过人之处，甚至有点不合逻辑。战斗系统、世界观设定等也直接来源于《火焰纹章》。然而正是由它是美国人见过的第一款曰式S·RPG，而且在当时RPG这种游戏类型在美国开始逐渐流传开来，习惯AD&D翟唤棋游戏的美国人对SLG也拥有天生的好感。《光明力量》适合时宜的推出受到了广泛欢迎，游戏在美国的销量达到60多万套，成为当时美国最为畅销的家用机RPG。该作在地图和战斗模式上采用伪3D构图方式，战斗时镜头拉近的大魄力演出，以及漂亮的人物画像和个性十足的大量角色出演，也为其赢得了不小的人气
《光明力量》在美国发售后没多久，续作也在曰本上市了。1993年10月的《光明力量2 古代的封印》在前作基础上再次做出巨大的进化。游戏容量达到惊人的16Mbit，游戏系统、故事情节、画面、音乐等方面都达到了MD的颠峰水准。游戏讲述光之英雄与魔王之间的战斗。登场人物大幅上升，角色能力更加平衡、敌方AI大幅提高。由于正处于MD即将消亡的末年，该平台上已经几乎没有什么大作登场，世嘉为《光明力量2》付出了大量的广告费用，希望该作可以延长MD的寿命。虽然在曰本市场上，由于SFC上大量巨作的狙击《光明力量2》销量惨淡，不过在美国市场依然保持强健的销售势头。高桥兄弟还在次年推出了Mega CD上的《光明力量 CD》，该作是根据《光明力量外传》前两作的故事脚本进行重新制作，游戏品质相当不俗，被誉为MEGA CD主机必备游戏。
由于SFC的推出，MD机能上的优势荡然无存。面对SFC上一个个画面精美的游戏，世嘉借鉴了NEC的做法，推出了MD的光碟机Mega CD。当时MD的主机全球普及量已经远远超越PC-E，可惜当时CD-ROM技术并未有多大突破，91年推出的Mega CD价格依然高达49800曰元。为了体现该主机的优点，世嘉需要一款《天外魔境》那种体现CD-ROM大容量特点的RPG。而Game Arts的《露娜：梦幻之星》就在此时诞生了
《露娜：银河之星》是一款典型的传统RPG，游戏讲述了一个梦想成为英雄的普通男孩的故事，美丽的动画、动听的音乐、充满感情的配音，一个简单的故事向你娓娓道来。游戏没有FF那种壮阔的氛围，更贴近于DQ细水常流的感觉。正如开发商的GAME ARTS的名字，《露娜》是一款精致的艺术品。有些游戏虽然气势磅礴却缺乏灵魂，有些游戏虽然画面出众却毫无内容。而在《露娜》中，你看不到任何刻意雕琢的痕迹，却总能在不经意间被深深的打动。而感动你的往往只是淳朴的村民们一句不起眼的台词。音乐作为游戏的主题被完美的发挥到极致，发挥CD-ROM的大容量优势，游戏大胆的采用真人演唱主题曲，优美的旋律与游戏淡淡的冒险感觉浑然天成。在情节自然的发展过程中，玩家们的心情被不断感染，直至欲罢不能
由于自身普及量有限，在该平台上首先推出的《露娜：银河之星》并没有多高知名度。尽管在当时世嘉对该作的宣传也相当卖力，不过真正接触这款游戏的玩家并不多。其后Game Arts在SS和PS上推出了复刻版，虽然没有多大宣传，却因为自身超凡脱俗的品质而获得了巨大的成功。是一款“感动了100万人”的RPG经典名作。
Game Arts还在其后推出了资料片《露娜：永恒之蓝》，游戏更好的利用了Mega CD加大的内存和更快的卷轴速度，游戏画面更加细腻。此外游戏强化和战斗和目录系统，并且加入了一些新角色和村民。大受好评的动画、音乐也得以全面提升。可惜这款游戏也无力拯救没落中的Mega CD，世嘉为了应付任天堂和索尼的次世代主机而放弃了该平台，转而研发MD上的新一代强化外设SEGA 32X。不过这款主机尚未进入正轨又被世嘉放弃，转向32位主机SS的开发。
